Mayor Transparencia de los Datos con la Última Tecnología de Laboratorio Digital
Los avances del automatización han sido significativos y prometen acelerar y mejorar el proceso de investigación de nuevos medicamentos. También la adopción del formato automatizado de intercambio de datos denominado “EnzymeML” contribuye a aumentar la transparencia en los experimentos enzimáticos. Las investigaciones en ciencias catalíticas se enfrentan a un aumento tanto de la cantidad como de la complejidad de los datos de investigación, lo que dificulta su análisis y la obtención de conclusiones significativas. Este Dispositivo sirve como formato de intercambio de datos y ofrece la posibilidad de agilizar estos procesos y abordar los retos que plantean los datos.
EnzymeML
De la Universidad de Stuttgart procede EnzymeML, que sirve como formato digital para documentar los resultados de un experimento enzimático. Este formato facilita el almacenamiento de datos de forma estructurada, garantiza la trazabilidad y favorece la reutilización de los datos. Numerosas instituciones de investigación consideran que el tratamiento manual de los datos es un proceso lento y propenso a errores. Además, acceder a los datos de otros grupos de investigación y volver a analizarlos se ha convertido en todo un reto.
Complejidad de los datos
A la complejidad de los datos hay que añadir la falta de normas, los metadatos incompletos y la ausencia de datos originales, que contribuyen a la falta de transparencia. En consecuencia, esto crea dificultades para los centros de investigación que intentan replicar los resultados publicados por otros. Los investigadores que estudian la actividad catalítica, la selectividad y la estabilidad de las enzimas y las redes enzimáticas se enfrentan a estas dificultades. Estos investigadores trabajan en campos como la biotecnología industrial y la biomedicina. En estas áreas, los datos relacionados con experimentos enzimáticos son notablemente intrincados debido a diversos factores que influyen en las reacciones enzimáticas. Estos factores son la secuencia proteica de la enzima, el organismo huésped utilizado para la expresión recombinante, las condiciones de reacción y las reacciones secundarias no enzimáticas.
Inactivación o inhibición enzimática
A esta complejidad se añaden situaciones en las que factores externos pueden provocar la inactivación o inhibición de la enzima, y los resultados también pueden verse influidos por la evaporación del medio.
Los resultados también pueden verse afectados por la evaporación del medio. Para hacer frente a estos obstáculos, EnzymeML ofrece una solución completa al documentar íntegramente los resultados de un experimento enzimático. Abarca desde las condiciones de reacción y los datos medidos hasta el modelo cinético utilizado para el análisis de datos y los parámetros cinéticos estimados.
La era digital
El mundo digital fomenta el establecimiento de una vía de comunicación que conecta las plataformas experimentales, los cuadernos electrónicos de laboratorio, las herramientas de modelización cinético-enzimática, las plataformas de publicación y las bases de datos de reacciones enzimáticas. Gracias a la naturaleza estructurada y estandarizada de los documentos EnzymeML, los resultados experimentales que contienen pueden ser fácilmente intercambiados y reutilizados por otros grupos de investigación. Otra ventaja es que los datos en formato EnzymeML son legibles por máquinas, lo que permite su utilización en flujos de trabajo automatizados para el almacenamiento, visualización, análisis y reanálisis tanto de datos actuales como de datos publicados anteriormente. No hay limitaciones en el tamaño de cada conjunto de datos ni en el número de experimentos que pueden manejarse.
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